作品由“座敷童子”、“海坊主”、“无颜怪”、“鵺”、“化猫”五个小故事组成。 故事讲述了小镇上发生了奇怪的事件，在慌乱的村民面前出现了一个持退魔之剑的谜一般的卖药人，他能够通过退魔之剑斩杀引起慌乱的妖怪，但是拔出退魔之剑需要聚齐“形”、“真”和“理”。形即由人的因缘所构成的妖怪的形态；真即事件的真相；理即当事人真实的想法。拔出剑后，变为驱魔人，斩妖杀怪。
座敷童子篇 一个被人追杀的怀孕妇人逃到了一家旅馆，但是已经客满了，于是老板娘把她带到了一间从不住人的房间，在去房间的路上妇人听到了小孩的声音，但是这天旅馆里没客人带小孩来住，原来这家旅馆原本是家妓院，妓院里的女人怀孕了都是由老板娘堕的胎，而这些没出生就死了的小孩渴望出生，渴望被人爱，由此产生的怨恨让他们变成了妖怪，而最后还是母爱拯救了他们。 在日本神话里座敷童子是带给人们幸福和好运的妖怪，只要他住在某人的家里，这个家就会非常的繁荣，《怪化猫》则是把座敷童子改编成了非常悲伤的故事 。
海坊主篇 海坊主是一个发生在海上的商船上的故事，船上有着各式各样的乘客：肥头大脸想要暴富一把的船老板、自以为毫无畏惧的武士、有着怪腔怪调的修行者、快人快语的佣人小姐、比船老板更肥胖的有道高僧和其随行者。一群人想要向江户进发却因为有人利用磁铁改变的了罗盘的方向导致船行到号称怪物之海的海域。而如此做的犯人正在是上述众人之中，一时间这里倒成了个密室，而佣人小姐开始分析各人的犯罪嫌疑。海座头的出现把剧情推向了一个小高潮，在桥头弹奏着琵琶一个个询问着你所真正害怕的事物一边展现着你所惧怕的幻想，那种蚕食人心控制感官的恐怖蔓延在众人之间，随着海座头的问话，真相的脉络也渐渐展现。 事件的缘起：五十年前高僧的妹妹代替高僧祭海，高僧对妹妹替自己死去的愧疚与恐惧所产生的怨念把这片海域幻化成了妖怪之海。 海坊主：坊主就是和尚，和尚到了海上就是海坊主，也就是海和尚。 海座头：如果出海的渔夫突然被雾困住分不清前后左右，有时候前面的雾里就会映出人影，离近了一看，是个背着琵琶的琴师，当渔夫在他的指引下安全抵达岸边的时候，琴师依然站在海上远远相望，海座头是妖怪中的善类。
无颜怪篇 一个为满足母亲的虚荣心而嫁入贵族家族的女人，在遭受婆家人和丈夫的虐待后，因为过度的悲伤和压抑导致被无颜怪附身，在自杀后却不自知，只以为自己将夫家的人杀死，并将被处刑。而无颜怪则在每次的处刑前将其救出，并送回夫家，导致无限的轮回悲剧，最终由药郎将她从轮回中救出。 所谓的无颜怪就是女主人公心中的压抑幻化的妖怪，是一个备受欺辱，记不起自己原来的样貌和身份，连自己已沦为妖怪都不知道的悲哀灵魂。
鵺篇 传说谁能得到一种神秘的香木“东大寺”，能得到天下。于是想要得到“东大寺”的人便争相想成为的“东大寺”保管者——女主人琉璃姬的夫婿，最后四人决定用闻香来决出胜负，但是在比赛当天却只有三人到场，于是卖药郎以第四人的身份参加，在比赛过程中却发现了缺赛者的尸体，但是其他三人还是要继续，在这之中不断有人死亡，最后参加的人和琉璃姬都死了。其实琉璃姬，庭院里的小女孩还有老婆婆都是东大寺所变化而成的，而那些所谓的参赛者在很久以前就已经死亡了，他们的灵魂被妖怪所玩弄，每夜都在举行着无止境的组香游戏。 “东大寺”为了保持自己的盛名，故意制造出能给拥有它的人带来金钱和权利的传闻，迷惑一个又一个有贪婪野心的人进入它的圈套。最后被卖药郎斩灭。
化猫篇 在地下铁开通之际，几个看上去毫不相关的人被关在同一节车厢。陆续的有人消失。等到最后，却是一个枉死的女记者化为猫怪来复仇。一切都在卖药郎拔出退魔剑的的“形”“真”“理”中现出真相。
