主线故事梗概
世界由现世、尸魂界和虚圈构成，尸魂界是灵魂的居所，死神作为使者，引导现世的灵魂回到尸魂界，维持现世和尸魂界灵魂的平衡，而一些失去内心的灵魂则堕落成虚（恶灵），并会吞噬滞留在现世的灵魂，所以，死神的另一个任务是消灭虚。
尸魂界由瀞灵廷和流魂街构成，瀞灵廷位于尸魂界的中心，是护廷十三队的居所，灵王是尸魂界的精神象征，借由“王键”才能找到灵王的居所。110年前，尸魂界进行了一次队长的更迭，二番队队长兼隐秘机动队、邢军队长四枫院夜一推荐下属浦原喜助担任十二番队队长，浦原喜助爱好科学研究和发明，创建了技术开发局并担任第一任局长，他在研究中制造出“崩玉”，功能据说是可以模糊死神和虚的界限，进一步提升死神的能力。五番队队长平子真子的副队长是蓝染惣右介，他表面伪装得温和有礼，其实是一个野心家，他的斩魄刀“镜花水月”，功能是完全催眠，与他本人伪装、欺诈、操控他人的人格同出一辙，他在私底下秘密进行死神虚化的研究，并发展到拿死神做实验；101年前，因为频频发生死神神秘失踪案件，尸魂界组成了由平子真子、罗武、莉莎、日世里等人构成的调查组，然而一行人却不幸落入了蓝染设下的圈套，即将虚化并死去，随后及时赶到的浦原喜助救了他们，并尝试用崩玉来助其控制虚化。浦原被蓝染陷害，尸魂界的中央46室宣布其有罪，思枫院夜一将他和虚化的8人救出，从此，浦原喜助藏匿在现世，成为一个开杂货铺的老板，而思枫院夜一也变身成一只黑猫，隐匿行踪百年，8人掌握了假面的使用能力，成为了假面军团......在此期间，蓝染成为了五番队队长，市丸银成为了三番队队长，东仙成为了九番队队长......
101年后的今天，黑崎一护是一名15岁的男高中生，他有一项特异功能是可以看见灵魂，他的爸爸黑崎一心是前死神队长，妈妈在他5岁时为了保护他被虚吞噬了，他一直背负着害死妈妈的罪恶感活着，一护有两个妹妹，夏梨和游子，一家人以开诊所为生；朽木露琪亚是刚被派到现世空座町的一名死神，她在保护黑崎一护妹妹不被虚攻击时，因不敌而被迫将斩魄刀插入黑崎一护胸口，将死神力量转给了黑崎一护，失去死神力量的她无法回到尸魂界，借由浦原店长的义骸转学到一护班级，从此一护和露琪亚组成死神代理团队，继续完成杀死虚保护灵魂的任务。
死神代理二人组被尸魂界发现了，六番队队长朽木白哉和副队长阿散井恋次扼杀了一护的死神力量，将露琪亚带回尸魂界受罚。浦原喜助救了一护，帮助他自身的死神力量觉醒，得到了斩魄刀“斩月”，并为一护和同伴打开了通往尸魂界营救露琪亚的大门，陪一护一起的同伴包括：龙井织姬（女），能力是绚舜六花，最主要是治疗能力，可以拒绝一切事项；茶渡泰虎（男），双臂很有力量，最先萌发的力量是巨人的右臂，后在战斗中发现了魔人的左臂；石田雨龙（男），最后的灭却师（驱阴师），通过特殊的灵子弓来射箭杀死虚。在志波家族（海燕ý、空鹤、岩鹫）、山田花太郎（四番队六席）和觉悟后恋次的帮助下，一护一行人通过在尸魂界的战斗，成功营救露琪亚，也成功掌握了卍解“天锁斩月”，虽然戳穿了蓝染一伙儿的阴谋，但无法阻止他们带着崩玉进入虚圈。
虚圈是虚生活的地方，虚和虚之间会互相吞噬进化，大虚分为三个等级：最低级的基利安、中级亚丘卡斯和最高级的瓦斯托德，蓝染利用崩玉帮助大虚破面化，大大提升了虚的实力，组建了十刃为首的虚圈战士。蓝染先是将井上织姬威胁“绑架”至虚圈，诱使一护、茶渡和石田前往虚圈营救，后恋次和露琪亚偷偷来帮忙，直至尸魂界队长的增援，或战胜或消灭了除前3十刃在内的其他战士，一护也因此掌握了虚化的力量；但这只是蓝染计谋的一部分，前来营救的人被关在虚圈，而蓝染则带着银、东仙和前3十刃来攻打重灵地空座町，计划消灭空座町来制作王键；幸好尸魂界早有对策，通过浦原制作了巨大的转换界柱，将真正的空座町转换到尸魂界保护起来，并派其余队长副队长前来应战，然而蓝染凭借崩玉获得了巨大的力量，尸魂界队长、假面军团、浦原喜助、夜一和黑崎一心都来参战了，也无法战胜蓝染，蓝染也向一护透露崩玉真正的能力是读取周围人的期望并按照期望的方向进行引导，一护的成长历程也并非是偶然，而是蓝染操控下崩玉引导的结果。蓝染还是打开尸魂界的穿界门，到达了真正的空座町，追赶而至的一心和一护父子，利用穿界门中比现世快2000倍的时间，一护学会了“最后的月牙天冲”，随后在尸魂界打败了蓝染，并在浦原的帮助下成功封印了蓝染，但是为了保护自己生长热爱的城市和同伴，付出了丧失自己死神能力的代价。
之后1年7个月的时间里，一护作为一个普通高中生生活着，某天一位叫做银城空吾的人带着完现术和Xcution团队来到他面前，为一护恢复死神力量带来了一线生机，同时另一位叫作月岛的人徘徊在一护家人和同伴的周围，利用自己的完现术“终结之书”修改了他们过去的记忆，逼迫一护不得不修行完现术恢复力量，但最终这一切都只是骗局，银城空吾和月岛只是一个唱黑脸一个唱白脸，目的是夺取一护获得的完现术增加自己力量。一护绝望之时，露琪亚、浦原和爸爸一心到了，从背后刺了一护一剑，这把剑中有护廷十三队全部队长副队长的灵压，帮助一护恢复死神力量。银城空吾原来是上一代死神代理，他告诉一护代理证其实是监视器，然而一护选择了接受和保护，打倒空吾并实现了对他的救赎......
支线故事梗概
灵魂狩猎者篇：以狩矢神为首的灵魂狩猎者，他们有着永恒的生命，可以操控“娃娃”，是尸魂界一次实验爆炸后扰动现世灵魂产生的特殊一族，他们的创造者是死神兰岛，虽然努力想帮助他们得到尸魂界的认同，但最终尸魂界却抹杀他们。怀着对尸魂界的仇恨，他们展开了利用灭却师之剑，前往尸魂界复仇的计划......
霞大路家族争端（“貘驳刀篇”）：霞大路家是尸魂界仅次于四大家族的上层贵族，掌管着为皇族制造兵器的重任。这一代继承人琉璃千代还小的时候，父母过世了，云井偷偷制造了邪恶的兵器貘驳刀（可吞噬使用者的灵压增强 兵器的力量），并妄图杀害琉璃千代篡权，被忠心的手下犬龙和猿龙护送着逃到现世的琉璃千代，希望得到一护和同伴的帮助，从现实到尸魂界，原来最终的幕后大boss是接任三番队队长的天贝绣助......
斩魄刀异闻录：“村正”是朽木响河的斩魄刀，他具有煽动和控制其他斩魄刀的能力。朽木响河少年得志，能力超凡，被陷害后反叛尸魂界，被山本总队长和朽木银铃共同封印了。数百年来，村正通过吸食虚的力量维持实体化，并通过实体化其他的斩魄刀们，设计圈套获得响河的封印之地，试图救出响河......
