2002年，那时玛雅人的末日预言尚未兴起，搬上荧幕的影视作品更是寥寥无几，而就在当时，一部《RahXephon》却率先预演了末日神话，出渊裕以玛雅文明为背景提出了对于世界末日的设想——2012年，来自异次元的种族MU在东京上空降下，人类和MU开战，结果人类大败，东京成为了MU的统治领域，被能量场包裹起来，从此与世隔绝。《RahXephon》一经播出，就凭借其史诗般的规模和大气的世界观而被公认为是当年最出色的动画。
东京在不同的动漫作品里总是是非争议之地。它在CLAMP笔下是天龙地龙决斗的战场；它在椎名高志笔下是恶灵招摇的混乱都市；它是梶岛正树创造出来的时间之门；而到了出渊裕手上，东京又被赋予了新的意义，它是一颗被能量场包裹起来的巨型球体，外表因与木星相似而得名“TOKYO JUPITER”。木星内外部时间流动速度相差六倍。TOKYO JUPITER的天空里漂浮着人形兵器DOLEM，操纵兵器并统治这块地域的是身体里流淌着蓝色血液的异类MU族。
《RahXephon》给人最突出的感觉，就是它和《EVA》无药可救的相似。的确，在《EVA》取得革命性成功之后，业界相继诞生了一大批流水线作品，但是品质良莠不齐，纵观其中只有《RahXephon》算是效仿到了精髓，比如设定，比如世界观，比如遣词造句，甚至还有那句经典的“我是谁”。然而出渊裕和庵野痞子对待观众的态度却截然不同，相较于《EVA》最后两集的混乱不清，《RahXephon》的整体框架显得非常有条理，谜题虽大但是该交待的都给你交待到位，所以只要你细心就能够看明白。并且动画的主旨并不晦涩，它没别的，就是一则动人的爱情故事，只是因为手法的朦胧而又有了不同的解读。
【剧情补完】
15年前，当他还叫神名绫人，当她还叫美屿遥的时候，那一年他们都是14岁。
西历2012年12月27日，暴风雨来临前的宁静，神名绫人和美屿遥在放学后的漫长黄昏里，享受着风平浪静的二人世界。初恋的对象就像是落日一样温暖而又沉静。音乐平缓地流淌，两只手扣在一起，红晕悄悄地爬上了少年的脸颊。
2012年12月28日，玛雅人预言的KATUN周期终结之日到来得措手不及，MU的空中都市忽然从天而降，当时的驻日美军和日本自卫队联合发起进攻并在后期使用战术核武器，结果却是惨败。MU侵占了东京，TOKYO JUPITER从此形成，一道十公里厚的屏障将东京硬生生地从地球上挖去，也将绫人与遥遗弃在了时间的彼岸。
从此，TOKYO JUPITER成为了时间的分野，生活在里面的人被MU洗脑、同化，他们被灌输了“东京就是全世界”的谬论，越来越多的红血人觉醒成了蓝血的MU，觉醒前的记忆全部丧失。世界因多元而饱和，宛如无法调和的旋律，发出刺耳的噪音，濒临崩溃。
调律世界势在必行。RahXephon，调律世界之神，额上长着一对巨大羽翼的机器生物，它拥有名叫伊修特利的灵魂，它的操纵者有一个非常清脆动听的名字——Olin，当Olin17岁时，伊修特利会找到他，带领他登上RahXephon，拯救世界。
两架RahXephon，两名奏者，神名绫人和如月久远，他们一个在里面一个在外面，两人各自为政，却又心有灵犀，因为绫人身上有如月久远的基因（虽然剧场版里绫人又莫名其妙地成为麻弥亲生的了，但这不影响剧情，总之作者就是想告诉我们绫人有MU的血统）。巴贝姆财团为了寻找奏者而创造了RahXephon系统，用MU族如月久远的基因创造了一批克隆人，从他们中选择能够成为奏者的人。他们是神名绫人、如月树、一色真、海伦娜和七森小夜子，但是最终这其中只有绫人成为了奏者。
巴贝姆其实才是最神秘的角色，不仅因为他已经几万岁了，灵魂借助不同的躯体存活着，还因为他创造了这个RahXephon双人调律系统，牵扯出了环环相扣的谜团却始终难以解释他的动机——他明明是MU啊，在这个关键时候为什么不援助自己的种族？按照TV动画里的理解巴贝姆的目的是要用RahXephon调和世界，让错位的音符达到共鸣，把分隔的世界融合在一起，这么说巴贝姆就是这个世界的守护神啊！可是他的手段又有些不阴不阳，他要让两台RahXephon分别代表人类和MU开战，谁赢了世界就将被调向谁的一方，而他要做的，仅仅是冷眼观战等待一个结果，并且还要保证战斗过程中双方的势均力敌，就如同《罗德斯岛战记》里的灰色魔女卡拉一样，其实就是个打着“维持世界平衡”的幌子坐山观虎斗的阴谋家。
巴贝姆是神，他的意志高深莫测到连MU都始料不及。从剧场版《多元变奏曲》里我们了解到，如月久远因为觉醒了而成为了MU的奏者，这就将对人类极为不利，因为这样一来MU就可以提前开战了，于是巴贝姆下令封锁久远觉醒的消息，并且发动OVERLOAD作战，从MU的手中夺回神名绫人，趁着他血液还是红色的时候尽快培养他与RahXephon同化，代表红血一方出战。那一年，距离上次战争已经过去了整整十五年。
十五年的沧桑已经足以让那位美丽的长发少女变得面目全非，那一年美屿遥二十九岁，她加入了地球对MU战略研究机构TERRA，被派遣向东京寻找奏者。十五年后的神名绫人依旧活在遥心里，十五年后的神名绫人也仍然没有忘记自己的初恋，或许十五年的时间对于绫人来说还不足以具备忘掉一个人的摧毁力，因为外面的十五年仅仅是木星里的三年而已，只不过他绝对不会想到，十五年前的初恋对象，此刻竟然就是眼前一张完全陌生的脸孔，她还有了另一个完全陌生的名字——紫东遥。
十五年后的神名绫人刚好十七岁，再次重申一下是因为TOKYO JUPITER内外时间流动的速度差，所以木星里仅仅过了三年。绫人还是那个绫人，紫东遥摘下墨镜看得清清楚楚，十五年后对于绫人的记忆依然以难以替代的重量盘踞在她内心最深处。她义无反顾地接下了这次任务，她要寻找的不仅仅是人类的奏者，还要找回十五年前的初恋。
十七岁的绫人到了成为Olin（奏者）的年龄，他的母亲——MU族的领导者神名麻弥派人将他抓走去驾驶RahXephon，绫人抵抗几下可终究寡不敌众，这时紫东遥及时现身出手相救，绫人的伊修特利也出现了，她的模样令紫东遥大吃一惊——这不正是十五年前自己的模样吗？绫人无意识地跟着伊修特利上了地铁，紫东遥觉得事有蹊跷想追却没追上。伊修特利带领绫人来到世音神殿，蔚为壮观的一幕出现了——帕特农神庙一般的断壁残垣悬浮在空中，倾泻而下的水流包围着一枚白色的巨卵，这里美妙得如同天堂，神明即将在此诞生。
剧场版对于这一段剧情作了改动和压缩，但是最终都是想向观众交代绫人被遥成功地带了出去。只不过在剧场版里地铁站的伊修特利没有出现，紫东大婶把绫人电昏了（......29岁不再少女的心啊），然后将他带上了飞机，可是半路上绫人突然听到了RahXephon对他发出的召唤，他在那一刻成为了Olin，强烈的召唤力量使得紫东遥的飞机失灵了，坠进了世音神殿。绫人首次登上了RahXephon，很碇真嗣地反抗两下后就适应了RahXephon的操作，消灭了两个DOLEM，看到自己母亲流下了蓝色的血，然后一激动抓着紫东遥从TOKYO JUPITER里冲了出去。
从此，大小世界轮番碰撞，绫人的人生发生了巨大转折，恩怨情仇千转百回地纠葛在一起。神秘的水帘被揭开，真相在黑暗的最深处闪耀着扑朔迷离的光泽。
【可曾记得爱】
《RahXephon》的主题是“爱”，剧情以绫人和遥的爱为主线向前劈波斩浪，随后各个角色之间大大小小的爱支流一般融入进来，最后汇聚成了一大片汪洋肆恣的海洋。
紫东惠在总一和绫人之间徘徊的爱，朝比奈浩子对绫人悲情的爱，如月树和紫东遥没有结果的爱，小夜子对于如月树艰辛的单恋，金与总一的生死离别，还有六道大叔超越血缘的父爱，它们都是散落在沙滩上亮闪闪的贝壳，我们在感叹海洋的美丽时，不能忽略它们默默无声的点缀。
紫东惠一直都在追寻姐姐的脚步，她的眼泪只能流在姐姐的背影里，她的爱总是来得慢别人一拍。她想向八云总一表白的时候对方却已经心有所属了，而她后来爱上的绫人，却也在她出生之前就和姐姐有了海誓山盟。她虽然在大战之前终于向绫人表白，但是一切都已无事于补。
或许很久都不曾在意，但是看完之后告诫自己必须不能忽略的一个配角，朝比奈浩子，混血MU，当她看到自己受伤的胳膊流出蓝血时无法相信自己也变成了MU，于是央求绫人带她到外面去，殊不知，此刻浩子已经与她的DOLEM悄悄同步了，DOLEM尾随着浩子来到外面的世界，绫人的机器对着它一阵拳打脚踢，最后把它撕裂，那些没有说完的话，没有诉出的情，没有呐喊出来的疼痛，全部都化为了纸上支离破碎的片语只言，消陨在了飞溅的蓝血里。
她们为了爱情的付出同样也很感人，很心酸，但是就伟大而言，她们在紫东遥面前还是略显底气不足。
等待一个人等了十五年是什么滋味？也许只有紫东遥自己才最明白这其中说不尽的苦涩。
我们没有理由去要求神名绫人在十五年后还必须得执着于他的初恋，那样对于一个少年来说是多么的残忍。十五年的时间已经足够瓦解当初坚定的誓言，感情失去了双方的给予，只会在漫漫无期的等待中逐渐枯萎。
然而好在，有了TOKYO JUPITER，让事态又出现了转机。这是TOKYO JUPITER存在着的唯一一个积极意义，它把十五年换算成了三年，于是对绫人来说等待的滋味就不那么艰难了。
我们欣慰的是绫人还是记得遥的，这段感情的维系是多么的不易，它跨越了时间的长河，藐视着生死的意义，如同是神的躯干，傲然屹立于天地之间，站成一种虔诚的信仰。
遥还是绫人记忆深处的美屿遥，那时她还没有改名，留着长发。木星事件爆发之后，绫人失去了遥，可他心中的那个美屿遥依然会时常以伊修特利的化身形象出现，但是绫人明白，这不是真正的美屿遥，她随时都可能消失在一个转角一个梦醒的早晨，而且她还有一个不同的名字——美屿铃香。
但那时的绫人显然不了解RahXephon的秘密，不知道RahXephon的灵魂会以自己最在意的人的形象出现。遥只是他画稿里的黄裙女孩，她面朝大海，春暖花开，回眸一笑百媚生。
后来绫人在外面明白了真相，知道紫东遥就是当年的美屿遥，他并没有因为遥的衰老而大失所望，而是坚定地表示，我爱的是紫东遥，是现在的美屿遥。
然后各自都笑了，接着拥抱了，接吻了。浅黄色与银灰色是碧海蓝天之间最美丽的颜色搭配。
【神话的终章是新生】
一色真鲁莽的DOWNFALL作战打破了人类和MU之间短暂的和平维系，他动用武力扯开了TOKYO JUPITER的屏障，时间的流动瞬间变得紊乱，混沌的杂音充斥天空，人类和MU的最终决战爆发了，无数架DOLEM向人类发起猛攻，无数位战友牺牲了，DOLEM宛如一把把沉默的尖刀，在天空里岿然不动地迎击着殊死一搏的人类。
然而更加不幸的是，此刻的神名绫人觉醒了，他的血液变成了蓝色，一旦他和RahXephon融合，那么他就将不再是人类，过往的记忆消陨得一干二净。RahXephon的暴走几乎要把方圆百里夷为平地。
功刀仁死了，艾尔菲死了，凯西死了，八云总一死了，那些活力四射的身影与挺拔俊朗的体格全部都成为了世界的陪葬品，末日的序幕拉开，暗哑的音色开始悲鸣，死神高高地站着，露出寒光熠熠的冷笑，掉落一片片伤人的羽毛。
可是紫东遥并没有因为绫人的失忆而放弃对他的追逐，她追寻了他那么多年，穿越木星，上天下地，生死早就置之度外了，她驾着飞机冲上天空，可是却被RahXephon发出的超声波击得粉碎。
《RahXephon》的最后一集绝对是这部最高水准的动画里最值得人仔细玩味的一集，大量的意识流表现手法层出不穷，能否从中捕捉到足够的信息是理解这部作品的关键。此时的神名绫人和如月久远已经不是他们本人了，而是RahXephon的化身，此时的紫东遥也已经死了，但是他们三个人依然在通过灵魂彼此沟通。看明白之后发现如月久远才是最应该感谢的人呐！她虽然是另一个RahXephon，但是她并没有打算和绫人杀得你死我活，而是决定要帮助他找回失去的记忆。这一段里出现了地铁、电视和电话这些典型的意识流表征意象，地铁象征着记忆的回溯，而电视里的画面则是过去的回忆在绫人的脑海里重现的过程。画面上出现了浩子、鸟饲守、紫东惠、总一还有艾尔菲，他们每个人都在和绫人打着友好的招呼，那里面没有战争，没有仇恨，没有悲伤，没有一切的是是非非，有的只是最真挚的友情和爱情。
绫人问遥，如果给你选择，你会选择什么样的过去呢？
遥有些控制不住自己的情绪，声音微微发抖：“我......我一直想和神名君呼吸同一个世界的空气，踏着同一块地面，度过相同的岁月，我......我......我想和神名君一起变成大人！”
天荒地老，永不分开。
场景切换到黄昏里的教室，初恋时的记忆终于被唤醒，在脑海的最深处荡起了细微的波纹。青鸟落在了久远的肩头，感谢这位美丽的使者，将神话引向了幸福的终章。
在这场大战中，输得最彻底的是巴贝姆，他要的是一个你死我活的结局，却万万没想到绫人竟然创造了一个人类和MU和谐共处的世界。也许巴贝姆从计划一开始就打错了算盘，因为绫人是人类和MU的孩子，他与人类有着友情和爱情，与MU又有着亲情，所以他不会摧毁任何一方，只是通过自己的力量让人类和MU共存，调律全世界的杂音使之统一。这个世界已经不再需要巴贝姆了，一声枪响，巴贝姆最后一个克隆人被打死，他的灵魂再也寻找不到寄居的躯壳了。
代表红血一方的绫人最后战胜了代表蓝血一方的久远，他获得了调律世界的选择权，但他并没有杀死久远，而是将她变成了自己身体的一部分，这也意味着红血人包容和接纳了蓝血的MU，战乱的年代已经过去，哭泣的人笑了，昏迷的人醒了，失散的人重逢了，纠结的人释然了，那些死去的人全部都获得了新的生命，RahXephon巨大的羽翼覆盖了地球，羽毛散落成新的天空，世界在一枚白色的巨卵里静静地等待着重生。
神话的终章落幕了。这一刻，明快的音色卷走所有不悦的忧伤。
东京在不同的动漫作品里总是是非争议之地。它在CLAMP笔下是天龙地龙决斗的战场；它在椎名高志笔下是恶灵招摇的混乱都市；它是梶岛正树创造出来的时间之门；而到了出渊裕手上，东京又被赋予了新的意义，它是一颗被能量场包裹起来的巨型球体，外表因与木星相似而得名“TOKYO JUPITER”。木星内外部时间流动速度相差六倍。TOKYO JUPITER的天空里漂浮着人形兵器DOLEM，操纵兵器并统治这块地域的是身体里流淌着蓝色血液的异类MU族。
《RahXephon》给人最突出的感觉，就是它和《EVA》无药可救的相似。的确，在《EVA》取得革命性成功之后，业界相继诞生了一大批流水线作品，但是品质良莠不齐，纵观其中只有《RahXephon》算是效仿到了精髓，比如设定，比如世界观，比如遣词造句，甚至还有那句经典的“我是谁”。然而出渊裕和庵野痞子对待观众的态度却截然不同，相较于《EVA》最后两集的混乱不清，《RahXephon》的整体框架显得非常有条理，谜题虽大但是该交待的都给你交待到位，所以只要你细心就能够看明白。并且动画的主旨并不晦涩，它没别的，就是一则动人的爱情故事，只是因为手法的朦胧而又有了不同的解读。
【剧情补完】
15年前，当他还叫神名绫人，当她还叫美屿遥的时候，那一年他们都是14岁。
西历2012年12月27日，暴风雨来临前的宁静，神名绫人和美屿遥在放学后的漫长黄昏里，享受着风平浪静的二人世界。初恋的对象就像是落日一样温暖而又沉静。音乐平缓地流淌，两只手扣在一起，红晕悄悄地爬上了少年的脸颊。
2012年12月28日，玛雅人预言的KATUN周期终结之日到来得措手不及，MU的空中都市忽然从天而降，当时的驻日美军和日本自卫队联合发起进攻并在后期使用战术核武器，结果却是惨败。MU侵占了东京，TOKYO JUPITER从此形成，一道十公里厚的屏障将东京硬生生地从地球上挖去，也将绫人与遥遗弃在了时间的彼岸。
从此，TOKYO JUPITER成为了时间的分野，生活在里面的人被MU洗脑、同化，他们被灌输了“东京就是全世界”的谬论，越来越多的红血人觉醒成了蓝血的MU，觉醒前的记忆全部丧失。世界因多元而饱和，宛如无法调和的旋律，发出刺耳的噪音，濒临崩溃。
调律世界势在必行。RahXephon，调律世界之神，额上长着一对巨大羽翼的机器生物，它拥有名叫伊修特利的灵魂，它的操纵者有一个非常清脆动听的名字——Olin，当Olin17岁时，伊修特利会找到他，带领他登上RahXephon，拯救世界。
两架RahXephon，两名奏者，神名绫人和如月久远，他们一个在里面一个在外面，两人各自为政，却又心有灵犀，因为绫人身上有如月久远的基因（虽然剧场版里绫人又莫名其妙地成为麻弥亲生的了，但这不影响剧情，总之作者就是想告诉我们绫人有MU的血统）。巴贝姆财团为了寻找奏者而创造了RahXephon系统，用MU族如月久远的基因创造了一批克隆人，从他们中选择能够成为奏者的人。他们是神名绫人、如月树、一色真、海伦娜和七森小夜子，但是最终这其中只有绫人成为了奏者。
巴贝姆其实才是最神秘的角色，不仅因为他已经几万岁了，灵魂借助不同的躯体存活着，还因为他创造了这个RahXephon双人调律系统，牵扯出了环环相扣的谜团却始终难以解释他的动机——他明明是MU啊，在这个关键时候为什么不援助自己的种族？按照TV动画里的理解巴贝姆的目的是要用RahXephon调和世界，让错位的音符达到共鸣，把分隔的世界融合在一起，这么说巴贝姆就是这个世界的守护神啊！可是他的手段又有些不阴不阳，他要让两台RahXephon分别代表人类和MU开战，谁赢了世界就将被调向谁的一方，而他要做的，仅仅是冷眼观战等待一个结果，并且还要保证战斗过程中双方的势均力敌，就如同《罗德斯岛战记》里的灰色魔女卡拉一样，其实就是个打着“维持世界平衡”的幌子坐山观虎斗的阴谋家。
巴贝姆是神，他的意志高深莫测到连MU都始料不及。从剧场版《多元变奏曲》里我们了解到，如月久远因为觉醒了而成为了MU的奏者，这就将对人类极为不利，因为这样一来MU就可以提前开战了，于是巴贝姆下令封锁久远觉醒的消息，并且发动OVERLOAD作战，从MU的手中夺回神名绫人，趁着他血液还是红色的时候尽快培养他与RahXephon同化，代表红血一方出战。那一年，距离上次战争已经过去了整整十五年。
十五年的沧桑已经足以让那位美丽的长发少女变得面目全非，那一年美屿遥二十九岁，她加入了地球对MU战略研究机构TERRA，被派遣向东京寻找奏者。十五年后的神名绫人依旧活在遥心里，十五年后的神名绫人也仍然没有忘记自己的初恋，或许十五年的时间对于绫人来说还不足以具备忘掉一个人的摧毁力，因为外面的十五年仅仅是木星里的三年而已，只不过他绝对不会想到，十五年前的初恋对象，此刻竟然就是眼前一张完全陌生的脸孔，她还有了另一个完全陌生的名字——紫东遥。
十五年后的神名绫人刚好十七岁，再次重申一下是因为TOKYO JUPITER内外时间流动的速度差，所以木星里仅仅过了三年。绫人还是那个绫人，紫东遥摘下墨镜看得清清楚楚，十五年后对于绫人的记忆依然以难以替代的重量盘踞在她内心最深处。她义无反顾地接下了这次任务，她要寻找的不仅仅是人类的奏者，还要找回十五年前的初恋。
十七岁的绫人到了成为Olin（奏者）的年龄，他的母亲——MU族的领导者神名麻弥派人将他抓走去驾驶RahXephon，绫人抵抗几下可终究寡不敌众，这时紫东遥及时现身出手相救，绫人的伊修特利也出现了，她的模样令紫东遥大吃一惊——这不正是十五年前自己的模样吗？绫人无意识地跟着伊修特利上了地铁，紫东遥觉得事有蹊跷想追却没追上。伊修特利带领绫人来到世音神殿，蔚为壮观的一幕出现了——帕特农神庙一般的断壁残垣悬浮在空中，倾泻而下的水流包围着一枚白色的巨卵，这里美妙得如同天堂，神明即将在此诞生。
剧场版对于这一段剧情作了改动和压缩，但是最终都是想向观众交代绫人被遥成功地带了出去。只不过在剧场版里地铁站的伊修特利没有出现，紫东大婶把绫人电昏了（......29岁不再少女的心啊），然后将他带上了飞机，可是半路上绫人突然听到了RahXephon对他发出的召唤，他在那一刻成为了Olin，强烈的召唤力量使得紫东遥的飞机失灵了，坠进了世音神殿。绫人首次登上了RahXephon，很碇真嗣地反抗两下后就适应了RahXephon的操作，消灭了两个DOLEM，看到自己母亲流下了蓝色的血，然后一激动抓着紫东遥从TOKYO JUPITER里冲了出去。
从此，大小世界轮番碰撞，绫人的人生发生了巨大转折，恩怨情仇千转百回地纠葛在一起。神秘的水帘被揭开，真相在黑暗的最深处闪耀着扑朔迷离的光泽。
【可曾记得爱】
《RahXephon》的主题是“爱”，剧情以绫人和遥的爱为主线向前劈波斩浪，随后各个角色之间大大小小的爱支流一般融入进来，最后汇聚成了一大片汪洋肆恣的海洋。
紫东惠在总一和绫人之间徘徊的爱，朝比奈浩子对绫人悲情的爱，如月树和紫东遥没有结果的爱，小夜子对于如月树艰辛的单恋，金与总一的生死离别，还有六道大叔超越血缘的父爱，它们都是散落在沙滩上亮闪闪的贝壳，我们在感叹海洋的美丽时，不能忽略它们默默无声的点缀。
紫东惠一直都在追寻姐姐的脚步，她的眼泪只能流在姐姐的背影里，她的爱总是来得慢别人一拍。她想向八云总一表白的时候对方却已经心有所属了，而她后来爱上的绫人，却也在她出生之前就和姐姐有了海誓山盟。她虽然在大战之前终于向绫人表白，但是一切都已无事于补。
或许很久都不曾在意，但是看完之后告诫自己必须不能忽略的一个配角，朝比奈浩子，混血MU，当她看到自己受伤的胳膊流出蓝血时无法相信自己也变成了MU，于是央求绫人带她到外面去，殊不知，此刻浩子已经与她的DOLEM悄悄同步了，DOLEM尾随着浩子来到外面的世界，绫人的机器对着它一阵拳打脚踢，最后把它撕裂，那些没有说完的话，没有诉出的情，没有呐喊出来的疼痛，全部都化为了纸上支离破碎的片语只言，消陨在了飞溅的蓝血里。
她们为了爱情的付出同样也很感人，很心酸，但是就伟大而言，她们在紫东遥面前还是略显底气不足。
等待一个人等了十五年是什么滋味？也许只有紫东遥自己才最明白这其中说不尽的苦涩。
我们没有理由去要求神名绫人在十五年后还必须得执着于他的初恋，那样对于一个少年来说是多么的残忍。十五年的时间已经足够瓦解当初坚定的誓言，感情失去了双方的给予，只会在漫漫无期的等待中逐渐枯萎。
然而好在，有了TOKYO JUPITER，让事态又出现了转机。这是TOKYO JUPITER存在着的唯一一个积极意义，它把十五年换算成了三年，于是对绫人来说等待的滋味就不那么艰难了。
我们欣慰的是绫人还是记得遥的，这段感情的维系是多么的不易，它跨越了时间的长河，藐视着生死的意义，如同是神的躯干，傲然屹立于天地之间，站成一种虔诚的信仰。
遥还是绫人记忆深处的美屿遥，那时她还没有改名，留着长发。木星事件爆发之后，绫人失去了遥，可他心中的那个美屿遥依然会时常以伊修特利的化身形象出现，但是绫人明白，这不是真正的美屿遥，她随时都可能消失在一个转角一个梦醒的早晨，而且她还有一个不同的名字——美屿铃香。
但那时的绫人显然不了解RahXephon的秘密，不知道RahXephon的灵魂会以自己最在意的人的形象出现。遥只是他画稿里的黄裙女孩，她面朝大海，春暖花开，回眸一笑百媚生。
后来绫人在外面明白了真相，知道紫东遥就是当年的美屿遥，他并没有因为遥的衰老而大失所望，而是坚定地表示，我爱的是紫东遥，是现在的美屿遥。
然后各自都笑了，接着拥抱了，接吻了。浅黄色与银灰色是碧海蓝天之间最美丽的颜色搭配。
【神话的终章是新生】
一色真鲁莽的DOWNFALL作战打破了人类和MU之间短暂的和平维系，他动用武力扯开了TOKYO JUPITER的屏障，时间的流动瞬间变得紊乱，混沌的杂音充斥天空，人类和MU的最终决战爆发了，无数架DOLEM向人类发起猛攻，无数位战友牺牲了，DOLEM宛如一把把沉默的尖刀，在天空里岿然不动地迎击着殊死一搏的人类。
然而更加不幸的是，此刻的神名绫人觉醒了，他的血液变成了蓝色，一旦他和RahXephon融合，那么他就将不再是人类，过往的记忆消陨得一干二净。RahXephon的暴走几乎要把方圆百里夷为平地。
功刀仁死了，艾尔菲死了，凯西死了，八云总一死了，那些活力四射的身影与挺拔俊朗的体格全部都成为了世界的陪葬品，末日的序幕拉开，暗哑的音色开始悲鸣，死神高高地站着，露出寒光熠熠的冷笑，掉落一片片伤人的羽毛。
可是紫东遥并没有因为绫人的失忆而放弃对他的追逐，她追寻了他那么多年，穿越木星，上天下地，生死早就置之度外了，她驾着飞机冲上天空，可是却被RahXephon发出的超声波击得粉碎。
《RahXephon》的最后一集绝对是这部最高水准的动画里最值得人仔细玩味的一集，大量的意识流表现手法层出不穷，能否从中捕捉到足够的信息是理解这部作品的关键。此时的神名绫人和如月久远已经不是他们本人了，而是RahXephon的化身，此时的紫东遥也已经死了，但是他们三个人依然在通过灵魂彼此沟通。看明白之后发现如月久远才是最应该感谢的人呐！她虽然是另一个RahXephon，但是她并没有打算和绫人杀得你死我活，而是决定要帮助他找回失去的记忆。这一段里出现了地铁、电视和电话这些典型的意识流表征意象，地铁象征着记忆的回溯，而电视里的画面则是过去的回忆在绫人的脑海里重现的过程。画面上出现了浩子、鸟饲守、紫东惠、总一还有艾尔菲，他们每个人都在和绫人打着友好的招呼，那里面没有战争，没有仇恨，没有悲伤，没有一切的是是非非，有的只是最真挚的友情和爱情。
绫人问遥，如果给你选择，你会选择什么样的过去呢？
遥有些控制不住自己的情绪，声音微微发抖：“我......我一直想和神名君呼吸同一个世界的空气，踏着同一块地面，度过相同的岁月，我......我......我想和神名君一起变成大人！”
天荒地老，永不分开。
场景切换到黄昏里的教室，初恋时的记忆终于被唤醒，在脑海的最深处荡起了细微的波纹。青鸟落在了久远的肩头，感谢这位美丽的使者，将神话引向了幸福的终章。
在这场大战中，输得最彻底的是巴贝姆，他要的是一个你死我活的结局，却万万没想到绫人竟然创造了一个人类和MU和谐共处的世界。也许巴贝姆从计划一开始就打错了算盘，因为绫人是人类和MU的孩子，他与人类有着友情和爱情，与MU又有着亲情，所以他不会摧毁任何一方，只是通过自己的力量让人类和MU共存，调律全世界的杂音使之统一。这个世界已经不再需要巴贝姆了，一声枪响，巴贝姆最后一个克隆人被打死，他的灵魂再也寻找不到寄居的躯壳了。
代表红血一方的绫人最后战胜了代表蓝血一方的久远，他获得了调律世界的选择权，但他并没有杀死久远，而是将她变成了自己身体的一部分，这也意味着红血人包容和接纳了蓝血的MU，战乱的年代已经过去，哭泣的人笑了，昏迷的人醒了，失散的人重逢了，纠结的人释然了，那些死去的人全部都获得了新的生命，RahXephon巨大的羽翼覆盖了地球，羽毛散落成新的天空，世界在一枚白色的巨卵里静静地等待着重生。
神话的终章落幕了。这一刻，明快的音色卷走所有不悦的忧伤。
