从制作上来说：
1.作画上反而退步了，没有初代那么精致，不知是不是因为版权原因，反正能看到的清晰度都不行，很影响观看体验。
2.配乐问题很大，突然响起的bgm非常的突兀，人物在跑的时候有非常重的喘息声，放到现在就等于是粗制滥造。
3.打牌过程中穿帮镜头太多，其实动画中有些不符合实际规则的行为都能容忍，但至少做到血量 牌差 数值不要出问题，但编剧一次又一次地用实际行动告诉我们他们有多敷衍。
剧情上：
真的太泡面了。初代第二集就开启与贝卡斯决斗的主线任务；5ds虽然是15集才开启幸运杯主线剧情，但第4集就交代了游星与杰克的宿命矛盾；Zexal更是第一集就交代了要收集99张No.的任务。而GX直到第25集才开始正式出现黑暗决斗以及七星任务，前期完全没有任何铺垫。一共三个主篇章，在开启主线之前只有主角团内斗交代每个人用的卡组有意义，其他的基本就是注水，而且与实际打牌规则相差太远，哪怕是为了卖卡都做不到宣传作用，更别说路人角色的卡组几乎都没有O化。
1.七星篇：讲道理作为一个组织，好歹大体风格以及卡组得差不多，结果7个里有4个算是临时工。另外三个里吹雪用真红眼，作为卡牌御三家 真红眼是城之内的象征，这样的安排就像是让其他人用社长的青眼一样让人反感，更何况吹雪作为与凯撒亮齐名的存在，剧中就没赢过，本体用的卡组还莫名其妙，实属拉胯；大德寺老师一开场逼格极高，秒杀万丈目和明日香，实际卡组却给人一种很弱的感觉，没有强力怪兽，战术上也完全靠的印卡，没有一个压轴的魄力；只有吸血女才在表现和人物设计算得上真正的反派。就本篇章的Boss影丸，也是一种得到力量的外行，结尾也很操蛋，搞出那么大的事件就一句我错了就洗白了。
2.光之波动篇：从53集爱德登场，66集交代正义的黑暗力量与邪恶的光之波动，主线故事直到84集的GX大会才算开始，不过相较第一篇好在主角团的内斗和团战挺有看头，以及地狱凯撒黑化的鞭尸贡献了名场面。但整个GX大会，编剧好像是要模仿决斗者城市，但规则却很混乱，此剧情分为两条线，一条爱德找到杀父仇人以及光之波动附身者的暗线，一条万丈目挫败对手获得冠军的明线。实际两条线的关键人物根本不是十代，大家围绕着十代就真的只是因为他是主角，而且十代翻盘真就完全依赖运气，看不到一点战术上的智谋，这样的主角很难让大众喜欢，甚至于我认为这个篇章的主角就是爱德，而他对上斋王的失败真就是为了给主角十代让步的剧情杀。唯一的亮点是子安配的斋王真正撑得起Boss这一身份，夸张的颜艺和病娇的声线太有梗了。
3.尤贝尔篇：此篇章在主线上算是节奏很快，眼镜蛇教授上来就表示要收集决斗者的精气，基本都是主角团之间的互斗，很有看点，算是一大进步。但在进入异世界后又有一种初代埃及篇的感觉，但初代埃及篇是找寻王之记忆很重要的内容，GX则是给人一种很混乱的感觉，一开始是为了获得虹龙能回到现实世界还较为清晰，但在二度回到异世界找回约翰的过程中前后剧情很矛盾，没有一个合理的世界观构筑。一开始十代黑化成霸王成为了世界的主宰，为什么恢复后阿蒙就因为得到艾克佐迪亚又能成为王？他被尤姐打败后尤姐在这个世界又算是什么？她又是怎么冷不丁被光之波动影响，讲真打到最后说自己因爱生恨观众反而更能接受，别再套娃把光之波动挖出来鞭尸。从重返异世界后真的剧情不重要了，唯一亮点就是邪心教典发动后每一场决斗都很高能，能图一爽就够了，最后十代与尤贝尔融合也是不错的处理，算是升华了。
4.Darkness篇：万恶的画蛇添足篇，真的终结在尤贝尔篇让十代消失更好，这个篇章真的要剧情没剧情要打斗没打斗，单纯为了填七星篇中的Darkness，真的有这功夫还不如说清楚尤姐是怎么被光之波动影响的，Boss换来换去很影响流畅度。而且这个Boss是史上最没排面的Boss，跟5ds的Zone还有Zexal里的上千主上比没压迫感和绝望感就算了，跟前头的阶段Boss比都掉价，眼镜蛇教授都比他强，被十代压着打，还没什么故事，不知道设计出来干啥。
