没有痛苦相伴的教训毫无意义

相比较与03版的钢之炼金术师，09版更加贴近原著，完成度更高，虽然两个版本都极为优秀，但09版明显更为完美，整个故事紧紧围绕着“等价交换”这个原则进行，从头至尾的故事都严格遵循这个世界观进行。

主角兄弟二人想通过炼金术复活母亲却失去身体，为恢复自己的身体踏上旅途，在寻找恢复身体方法的过程中，被迫卷入了一个巨大的阴谋中，二人有多次机会通过牺牲他人甚至是恶人恢复身体，但是二人却坚持“失去身体是自己咎由自取，绝不能依靠伤害别人达成目的”这个看似呆板的原则，但是每一次的抉择和坚持之后二人却能获得一个又一个战友，并最终将这些原本水火不容的人团结到一起去解救整个国家，由一条自我救赎的主线展开，各个支线不断加入：被迫害的少数民族寻求复仇，渴望通过掌握国家权利来保护人民，不远万里寻求长生不老以保护族人这些支线依次展开又逐渐收拢汇聚成一条主线，各方势力勾心斗角，相互算计，步步为营将剧情推向长达30余集的高潮，丝毫不拖泥带水又抓人心弦。

整部动画剧情节奏由慢到快，进入高潮阶段以后一气呵成，所有的人物包括反派都刻画的十分丰满，打斗场景如行云流水，正反两派人物智商时刻在线，没有猪队友拖剧情，极大提高了观看体验。

尤为难得的是通篇动漫通过战争施害者和被害者两个视角传达了其反战的思想，通过斯卡的复仇线表明了面对巨大的民族伤害，不能一味的沉浸于复仇中，将暴力施加到更多无辜者身上，而应该一边向前进寻求和平一边对施害者进行严惩。通过火焰上校为挚友复仇一集表明当复仇变为暴力发泄时会让人迷失自我，步入深渊。通篇故事主角没有主角光环加持，面对被恶魔父亲做成试验品的小女孩的无奈，面对不能战胜的强大敌人的威胁时采用更灵活的方法去战胜他们，尽管屡遭挫折仍然坚持前行，最后更是升华了“等价交换”的内涵：“没有痛苦相伴的教训是毫无意义的，因为、人倘若不牺牲些什么，就什么也不可能得到。但是，当直面这些痛苦、克服它们的时候，人将获得不输给任何事物的坚韧的心。”