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幸運杯篇（第1話-第26話） 第1集 騎乘決鬥！加速！ 第2集 強力昆蟲卡組！蟻地獄的陷阱 第3集 逃脫！氮素戰士VS御用守護者 第4集 命運的對決！擋住去路的星塵龍 第5集 激突的王牌龍！星塵VS紅蓮魔 第6集 看吧！我的祕寶卡組！ 第7集 灌注於卡里的感情！水晶頭骨VS大牛鬼 第8集 得不到滿足的靈魂 龍印人與傳說之龍 第9集 被謀劃好的閃電生死戰 第10集 卡組0 打破鎖鏈陷阱的循環 第11集 特殊追緝卡組再臨 奪回與同伴的牽絆 第12集 死鬥追緝！編織牽絆吧 渦輪戰士 第13集 撥號！？咆哮吧 變形鬥士卡組 第14集 都市傳說 帶來破壞的黑薔薇魔女 第15集 命運杯決鬥開幕 第16集 魔女再來，破滅之龍 黑薔薇龍 第17集 火焰復仇者 速度之王☆骷髏炎鬼 第18集 古之森 精靈世界的邀請 第19集 被汙染的精靈世界 第20集 互不相讓的信念 我的使命與故鄉同在 第21集 復仇的波馬 悲傷的陷阱 戰車刺釘 第22集 被揭發的過去 第23集 決賽，隱藏於假面之後的內心 第24集 犧牲者的聖域 第25集 命運杯 最終決戰！ 第26集 龍印人們的命運 紅龍引導的未來 暗印者篇（第27話-第64話） 第27集 無光的世界 暗黑同調 第28集 吞噬一切的黑暗 不滅的暗印人 第29集 迫近的威脅！暗印人牛尾！？ 第30集 我的名字是克羅！飛翔吧 黑鳥號 第31集 故鄉與同伴 再會的組隊騎乘！ 第32集 自由的象徵 泰達路斯橋 第33集 復仇的劫火！昔日的好友 鬼柳京介 第34集 暗黑同調！出來吧 百眼龍 第35集 戰慄！地縛神 卡帕克·阿普 第36集 結合勇氣與力量！動力工具龍 第37集 潛入！桃源運動 這是我的回合 第38集 蘇生之魂 燃燒的新巨畫 第39集 降臨！兩隻地縛神 第40集 無法返回的過去 被關閉的心扉 第41集 由悲而生的憎惡！接住吧 星塵龍 第42集 集結！紅龍的眾戰士 第43集 各自的決心！能衷心信任的事物 第44集 掀起神風吧！黑羽-兵翼鴉 第45集 對決！擁有蜘蛛之痣的男子 第46集 17年前的真相 被掩蓋的暗印人陷阱 第47集 擁有猿猴巨畫之痣的男子 第48集 負世界 尋找白色獅子雷古勒斯 第49集 司負之王 猿魔王塞曼 第50集 負之詛咒！被囚禁的古代妖精龍 第51集 轉生吧！突破界限的騎乘決鬥 第52集 在卡片編織的回憶盡頭 第53集 狂吹的風暴 黑羽-孤高之銀風鴉 第54集 最後決鬥！滿足隊 第55集 同伴們的心意，救世龍 第56集 17年前的誓言 永轉機引導的命運 第57集 內心的黑暗 殘留的最後希望 第58集 在那前方的命運！地獄的霸者 暗之王 第59集 孤高之光 救世魔龍 第60集 悲情故事～悲傷的記憶～ 第61集 在真相的盡頭 第62集 最後之戰！擁有雙神的男子 第63集 最強的地縛神！維拉科查·拉斯卡 第64集 邁向我們的未來！ WRGP篇（第65話-第136話） 第65集 新的威脅 第66集 進化之證 同調怪獸 第67集 決鬥學園的傳統！古代的機械巨人 第68集 老人的記憶 廢鐵家庭卡組 第69集 威脅！貸款衍生物地獄 第70集 神隱森林 長眠美人 第71集 被囚禁的遊星 第72集 風中人 第73集 在同調召喚封印的前方 第74集 再進化！加速同調 第75集 十六夜秋 加速！ 第76集 崇高的惡魔混沌王 第77集 登場！超級精英轉校生 第78集 復活的噩夢！機皇帝 神空 第79集 前往未見的世界 第80集 神祕的超級機械工 第81集 耶格爾捕獲作戰 第82集 不動遊星 敗北概率100% 第83集 嫌疑犯！？傑克·阿特拉斯 第84集 另一個傑克 第85集 波波時鐘的老鍾 第86集 衝突鎮 第87集 救出鬼柳！流浪決鬥者之鎮 第88集 在勝利前方的陷阱 第89集 機炮食人魔的恐怖 第90集 死斗的疾走決鬥 第91集 組隊決鬥 鬼柳·遊星VS羅頓 第92集 滿足 第93集 戰慄！主從的覺悟 第94集 追憶 朋友託付的遺志 第95集 飛舞吧！黑羽龍 第96集 結成！5D's隊 第97集 在絕望和糾紛的前方… 第98集 WRGP開幕 5D's隊VS獨角獸隊 第99集 燃燒吧！鳳凰石蒜花 第100集 絕境 最後輪手遊星 第101集 為全隊 第102集 只為勝利 第103集 戰鬥盡頭所得之物 第104集 破滅的使者 災難隊 第105集 暗之卡 隱身騎士-鐵鉤- 第106集 幽靈氾濫！恐怖的大混戰模式 第107集 覺醒！毫不動搖的境界 明淨之心 第108集 復活的恐怖 機皇帝 神智 第109集 加速同調！生來吧！流星龍 第110集 太一三皇帝 第111集 古之地 納斯卡之行 第112集 紅蓮惡魔 第113集 熊熊燃燒的靈魂！真紅蓮新星龍 第114集 耶格爾捕獲作戰Ⅱ！ 第115集 逼近謎團吧！解殘局騎乘決鬥！ 第116集 永轉機特快開發機構 第117集 被歪曲的過去 第118集 新的競爭對手 第119集 鐵壁的並列！打碎強硬守備吧 第120集 連接心意吧！攜手魔人 第121集 奇蹟的王牌 睡巨人 咕咚！ 第122集 堅信的力量！咕咚VS流星龍 第123集 盧恩之瞳的決鬥者 第124集 被傷害的自尊 第125集 極神皇托爾VS真紅蓮新星龍 第126集 降臨！第二神 極神皇 洛基 第127集 激鬥！賭上命運的黑羽！ 第128集 不死身的三極神 吼叫吧，救世星龍第129集 加拉爾號角！步向終結的倒計時 第130集 連向未來的，與同伴的牽絆 第131集 賭上未來的戰鬥！ 第132集 強襲！！機皇帝 神智 第133集 擋住去路的巨帝！機皇帝 神陸 第134集 破滅之道！同調召喚所走到的未來 第135集 絕望魔人！機皇神 機錄∞3 第136集 決死的攻防！機皇神VS同調怪獸 弧線搖籃篇（第137話-第154話） 第137集 迫近的恐怖 神之居城「弧線搖籃」 第138集 通向未來的橋樑 虹橋碧佛洛斯特 第139集 幻惑之場！忘我畫派 第140集 魂縛門！被封閉的未來 第141集 絕望決鬥！機動要塞 極強音 第142集 賭上生死的戰鬥！機皇神龍 星標 第143集 生命的奇蹟，生命激流龍！！ 第144集 終結的起源 為未來的死鬥 第145集 比光更快！！ 第146集 最後的一人 忘-我 第147集 連向未來的希望！ 第148集 寄託於僅此1張的勝機 第149集 復活的英雄 第150集 父親託付的意志 第151集 聚集的祈願 第152集 應走的未來 第153集 相互碰撞的靈魂！ 第154集 邁向光芒照射的未來