第二部更多側重在數碼寶貝世界的擴容，所以數碼寶貝本身的戰鬥力一直是個謎。擴容:徽章的力量消失，數碼寶貝不能超進化；裝甲進化的存在為了對抗來自達高獸之海，被吸血魔獸帶出來的黑暗之塔的力量；優紀夫為了進入數碼寶貝世界被控制，創造黑暗種子，選擇適合的人去傳播黑暗之塔；因為相信而存在的力量，被選召的第二代開始戰鬥；六塊聖石保護著數碼寶貝世界的穩定，青龍獸擁有進化的力量；現實世界擁有通往數碼世界的大門，初代機只可以打開此大門（這個不確定），確定存在的靠想象而存在的世界，達高獸的海，迪路獸的神聖尾戒可以促使數碼寶貝合體進化等。
第二部有個超越主角團的主線，吸血魔獸借優紀夫在數碼世界栽培力量，逐漸破壞了數碼世界的穩定，黑暗之塔造出的怪物，開花結果的黑暗種子，逐漸連接的兩個世界。吸血魔獸蠱惑優紀夫，靠黑暗去實現他的理想，實則是吸血魔獸想要統治兩個世界。糟糕的事情一步步發生，貝利亞吸血魔獸復活，普通數碼寶貝無法應對，所以為了對抗他，而借用了所有被選召的孩子，也就是相信數碼寶貝存在的孩子的力量。因為相信夢想的力量，可以打敗黑暗。
因為側重點不同，兩部觀感還是有所區別，就人物上，還是喜歡有領導力的太一、聰明冷靜的光子郎和純真的美美，第二部主人公個性大體相似，阿武和嘉兒的本人的個性也被削弱，只是單純的跟隨團體行動。大輔是略微有個性:所謂沒心沒肺，勇往直前，但是這不是我想要的勇氣啊～小賢的塑造尚可，溫柔的徽章，做錯事後極度想彌補的愧疚心，溫柔處事的性格，相比較二代整體還是很鮮明瞭，不愧是親兒子。
總之二代世界觀擴容太多，格局太大，又有一定的級數限制，所以整個節奏很快，劇情無法延展只有選擇程序化的普通，不說無聊，合矩合理吧。
