各周目

一週目：
小炎轉學遇見了小圓，因為小炎內向害羞，加上班上同學的言語刺激，而心生怨念和抑鬱，這樣就產生了絕望。因而造成了魔女的產生。此時小圓和麻美出現，幫助小炎度過了危難。小炎受到鼓舞和憧憬。
在魔女之夜，麻美戰亡，小圓不得不挺身向前，最終也戰歿。小炎許下了成為保衛小圓的人的願望，和丘比達成了契約，成為了魔法少女。
二週目：
小炎重新迴轉時間，在學校裡，向小圓表明了自己的身份——成為了魔法少女。和麻美和小圓一起學習如何做一個有本事的魔法少女，學會了製作炸彈的方法，並和停止時間的特殊魔法相結合，成了自己的技能。在某次作戰中，小圓失敗，併成為了魔女，小炎繼續迴轉時間。
三週目：
小炎回到了過去，告訴了小圓麻美她們，魔法少女和魔女的真相。此時沙耶加也是魔法少女了，也提到了杏。但是她們並不相信小炎所說的。因為沙耶加不喜歡小炎的炸彈技能，小炎轉換技能為射擊。後來沙耶加成為了魔女，小圓麻美小炎以及杏一起和之作戰，小炎滅了沙耶加。而眾人也都相信了魔女即是魔法少女的殘酷現實。因為這，眾人開始崩潰。麻美殺了杏，小圓殺了麻美。小圓和小炎一起面對魔女之夜，戰敗。小圓為了救小炎，而選擇犧牲自己，並希望小炎能回去告訴自己，不要聽丘比的話成為魔法少女。小炎和小圓約定好了。為了不讓小圓成為魔女，小炎開槍殺了小圓。小炎再次迴轉時間。
四周目：
小炎回到過去，在小圓沒有成為魔法少女之前，警告小圓不要聽任何美麗的謊言。她選擇一個人去和魔女戰鬥，一個人面對一切，只是為了不連累任何心愛的朋友，特別是小圓。最後，她一個人面對魔女之夜，但是此時小圓已經被捲入其中。小圓為了拯救小炎而和丘比結下了契約，成為魔法少女的小圓，輕而易舉就戰敗了魔女之夜。同時，小圓的結果也是明顯的。她將成為最終的魔女。小炎選擇再次回去阻止小圓。
五週目：
小炎繼續選擇獵殺丘比的方式來阻止小圓成為魔法少女。在獵殺過程中，丘比還是和小圓見面了。
一週目和四周目的魔女之夜是一樣的。都是小圓所要去戰鬥的。一週目，小圓死了；四周目，小圓勝了。