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EVA是一個展現人性扭曲的故事，也是個反人類、反社會的故事，以全人類的毀滅結束。潛在受到了武士道精神的毒害，認為死亡是通往絕對自由的道路。罔顧人死亡之後，什么都沒有了的物質事實。有智者說過，在死亡的過程中，實際上靈魂比肉體消失的還要快，死了就沒戲了。以全人類化為血水，以死亡方式為"救贖"實在是令人無語，尤其是太空裡的巨靈自殺的模式，把武器插入腹部自盡。武士道認為腹部是靈魂所在，切腹而死是釋放靈魂自由的行為。
說到三個主角，個個都是人格扭曲的嚴重心理障礙者，幾乎都是自閉症患者。女主角凌波麗的人格障礙是不知道自己是什么。男主角真治的人格障礙是不想做自己，女二號明日香的人格障礙是用別人對自己的完全認同來代替自我價值的認同。
既然真治連自己都不想做又怎會想做別人，明日香很清楚的知道這一點，真治對她根本沒用，當然不會要他了。 凌波麗就是一個機器與莉莉絲化身、司令妻子靈魂的混合體，一個故事編劇的工具，是到了什么場景，就是行使什么角色職責的宗教符號。也是一個大多數時候無口無心無表情的自閉症患者。最讓人噁心的就是真治的人格演化，第25、26集所使用的靜止畫面風格進行心理敘述是可以接受的，問題是情節，真治沒有可能以故事編劇的幼稚方式而實現超越的，最後居然還是“好”了，故事編劇也太偽裝了，大敗筆。既然有心理缺陷，應該充分展現它，而非以根本不可能的方式“治癒”它，這是什么噁心的表現，好比給凸山塗綠油漆來實現綠化一樣，太偽了，就是在以極為庸俗的方式實現極難的心理超越，其實結果也並非心理超越而是更深層次的偽裝。整個過程讓人做嘔，好像一個被嚴重破壞的心理世界是幼稚的鬧劇，說颳風下雨就颳風下雨說放晴就徹底陽光明媚春光無限。到了大結局篇，真治本性有所重新迴歸真實，雖然缺陷依舊，但總算沒有延續大偽筆。
使徒裡面，就談一下17號使徒，因為它是究極使徒，明顯是有武士道精神的世界觀。17號使徒就要獲得入侵的最後成功時，事實上已經決定性的獲得了入侵成功，卻突然放棄攻擊而是選擇死亡。這是什么？知道嗎？是究極武士道。 武士道認為武士的究極追求是控制死亡，當達到了自己奮鬥的最高峰之後，將選擇死亡來通往絕對自由。 其死亡並非厭世，而是因為達到自己活著時候的成就的最高峰，不可能有更大成就了，此時只有控制自己的死亡，即選擇自殺或死於己之所選擇的死亡方式，來實現究極的絕對自由。在17號使徒的心中，真治就是那把“神聖”武士刀，以此等方式而了結，實在是最理想的了，它死的時候都帶著笑。如同櫻花，在盛開的最燦爛的那一天，一夜之間全部同時凋謝，絕沒有一片花瓣留在枝頭上。
大結局篇裡的，瞬間人類全滅的過程，顯然是讓人想起了櫻花之凋謝。要是準確的說，大結局篇裡，真治與明日香是作為缺陷而留在世上的，而非一種另類的完善。 是為了繼續潑灑的人性缺陷而遺留下來的種子。全人類之死滅，被解釋為集體融合全體救贖。而被留下的真治與明日香是什么？ 是作為人類的原罪而被放棄的，真正的放棄是自主選擇的放棄。真治與明日香是究級缺陷。他們只可能只會自主選擇被放棄。真正的被放棄，一定是自己選擇被放棄。 俗話說，知過能改善莫大焉。隨著劇情的發展，靈魂深入發現與衝擊的過程，最後時刻，真治與明日香是準確知道自身的人性原罪的，但是他們是知過不改罪莫大焉。他們因而是一種究極原罪。這才是EVA的故事。EVA故事是什么？第一階段，先是不知“過”，而為“過”找藉口找理由或迴避隱藏“過”，真治、明日香、凌波麗都被安排有不幸的童年或悲愴的往事、不堪的回憶等等。第二階段，由先是不知“過”，而知道“過”了，覺悟到“過”了，一次次衝擊精神的戰鬥是一次次精神與靈魂發現的過程。大結局是，雖然知道“過”了，但是選擇......。 EVA是個極為頹廢的故事，人很多都如此，尤其是"御閣族"容易受頹廢的影響，如同人容易被悲劇所感動。這裡所說的“過”，一種廣義的“過”，可以是人格缺陷，可以是各類人性陰暗面，也可以是“原罪”。 EVA有反宗教傾向，但是依然以一種宗教的最初衝動來反宗教，依然是大罪過。宗教本身就是一種原罪。EVA有試圖，但是還是沒有超越宗教，故事編劇的精神力量太有限了，應該很累吧，以日本文化背景出身的編劇，就算意淫了幾本哲學、宗教書籍，但是依然就像是還沒有會走路就想跑了，結果摔斷了骨頭，在地上哀嚎一樣。讓它好好毒害日本的一代又一代青年吧。這就是它的最大價值。