我渾身傷痛，跋涉萬里，疲倦地尋找，只為來與你相見。

故事描述一個住在深海里的人魚波妞，為了跟小男孩宗介一同生活，一心一意想變成人類；同時也描述了五歲大的宗介如何信守承諾的故事。五歲的宗介與媽媽理莎，住在一個靠海小村莊的山崖上。身為船長的爸爸長年出海，留下宗介與媽媽相依為命。因此五歲的宗介從小就超齡的懂事，也知道自己必須擔起家中的責任，要代替父親照顧媽媽。一天當他在山崖下岩石遍佈的海灘上玩耍，他拾回了一隻頭困在玻璃瓶裡的人魚波妞，宗介救出波妞並且將她養在一個綠色的塑膠水桶裡。 影片從波妞出逃開始，隨著波妞出逃的路線，鏡頭從波妞父親——邪惡魔法師藤本的潛艇漸漸轉移到了宗介所住的懸崖下。在這一開場的轉移中，背景從流光溢彩的深海世界慢慢變成了骯髒、雜亂的人類社會的海底垃圾場，兩個場景形成了強烈的對比。在本片中，他也表達了自己心中理想的人類發展和自然生態的相對關係的看法，既一種人類和自然的平衡。如果觀眾多留心這些片段的話，就不難理解後來藤本對波妞講的話，“人類會把生命從海里奪走”“我也曾經是人類，我為了不再是人類付出了多少……”。