保護環境

這劇看起來劇情中好像只有愛情或者友情而已，但是劇中除此意外還有許多隱藏的含義，首先是藤本，他是波妞的爸爸，原本是一個人類，然而身為人類卻討厭人類，是因為看到了人類對海水的汙染，但最後因為愛上了波妞的媽媽而放棄當人類。

確實，藤本討厭人類就是因為人類肆意的汙染海水，導致波妞姐妹們居住的地方充滿著垃圾，這不得讓人聯想到現實的海洋，許多的報道例如在一些大魚的肚子裡有許多人類的垃圾，又或者是海龜的鼻子被吸管塞住而導致呼吸不暢。而波妞第一次登場就是在玻璃瓶裡出現，最後是宗介打爛瓶子，波妞才得以解脫，這是人類亂扔垃圾，波妞才會鑽到玻璃瓶中。

宮崎駿老師從側面呼籲大家保護海洋，不要亂扔垃圾到海水裡。